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　　高效毛细管电泳仪(HPCE)是以毛细管为分离通道，以高压直流电场为驱动力，利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离，是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展，使分析科学从微升级进入到了纳升级水平，不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能，也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。HPCE与高效液相色谱仪比较如下：

　　一、相同点：

　　1、检测器：

　　HPCE和高效液相色谱仪均可采用紫外检测器、荧光检测器和电化学检测器等。但由于HPCE采用在柱检测，光路短，灵敏度和线性范围都不如高效液相色谱仪。

　　2、定性和定量方法：

　　HPCE的定性和定量方法与高效液相色谱仪相同，采用出峰时间定性，峰面积或峰高定量。

　　3、柱效和分辨率：

　　HPCE的柱效和分辨率计算方法与高效液相色谱仪相同。

　　二、不同点：

　　1、分离原理：

　　(1)HPCE：基于组分在载体电解质中迁移速度的不同。

　　(2)高效液相色谱仪：基于组分在固定相和流动相之间分配系数的不同。

　　2、分离模式：

　　(1)HPCE：毛细管区带电泳、毛细管胶束电动色谱、毛细管凝胶电泳、毛细管等电聚焦电泳和毛细管等速电泳等。

　　(2)高效液相色谱仪：正相色谱、反相色谱、离子交换色谱和凝胶色谱等。

　　3、分离柱：

　　(1)HPCE：小内径毛细管柱内装不同载体电解质。

　　(2)高效液相色谱仪：小内径毛细管柱内装不同固定相。

　　4、进样方式：

　　(1)HPCE：电动进样、压力进样和扩散进样。

　　(2)高效液相色谱仪：微量注射器进样、六通阀进样和自动进样器进样。

　　5、进样体积：

　　(1)HPCE：纳升级。

　　(2)高效液相色谱仪：微升级。

　　6、溶质驱动方式：

　　(1)HPCE：以高压直流电场为驱动力。

　　(2)高效液相色谱仪：以高压输液泵驱动流动相。

　　7、采用毛细管的目的：

　　(1)HPCE：有效散热，使径向温度梯度更小。

　　(2)高效液相色谱仪：消除涡流扩散，缩短组分在流动相中的传质过程。

　　8、柱效：

　　(1)HPCE：72万TP/m，大分子更大，尤其生物大分子可达3000万TP/m，能检测到单细胞和单分子水平。

　　(2)高效液相色谱仪：一般为25TP/m，大分子更小。

　　9、柱价：

　　(1)HPCE：柱价低，

　　(2)高效液相色谱仪：柱价高，且易沾污，易失效。

　　10、分离液：

　　(1)HPCE：在水溶液介质中进行，不污染环境。

　　(2)高效液相色谱仪：常在含有机溶剂(如甲醇等)介质中进行，易造成环境污染。